Zum Inhalt:

15 Jahre nach der Mega-Explosion in der Antarktis, besser bekannt als "Second Impact", wird die Erde schon wieder von engelartigen, mit Superkräften ausgestatteten Wesen bedroht, welche imstande sind, einen "Third Impact" zu verursachen. Der 14jährige Shinji Ikari tritt zunächst nur widerstrebend seinen Dienst als Pilot der bio-mechanischen Kampfmaschine, Evangelion Unit-01, zusammen mit seinen EVA-Piloten Kolleginnen Asuka Langley und Rei Ayunami an. Aber nichts ist so, wie es scheint. Geheime Regierungsorganisationen versuchen die Kinder und ihre EVAs zu manipulieren und für ihre Zwecke zu mißbrauchen. Shinji, Rei und Asuka müssen sich ihrer Vergangenheit stellen und das Geheimnis ihrer eigenen Identitäten lüften.